شما وقتی با دستور به مراجع، شکل، جدول و فرمول و ... ارجاع میدین بسته hyperref اونو براتون به صورت لینک و قابل جهش درمیاره اون کادرها نشون میده اینا لینک شدن و قابل ارجاع هستن.
برای حذف مربع های سبز و قرمز
این دستور رو بذارین قبل از بیگین داکیومنت
\hypersetup{hidelinks}
البته به شرطی که بسته hyperref تو فایلتون فراخوانی شده باشه